AlphaFold3, 비상업적 용도로 누구나 사용 가능하도록 공개 (feat. Google DeepMind)

9bow · 11월 12, 2024, 9:59오전

AlphaFold3 소개

구글 딥마인드(DeepMind)의 AI 기반 단백질 구조 예측 모델 AlphaFold3이 드디어 오픈 소스로 공개되었습니다. AlphaFold 팀을 이끄는 존 점퍼와 CEO 데미스 허사비스는 최근 2024년 화학 노벨상 공동 수상자로 선정되었으며, 이들의 연구 성과가 포함된 AlphaFold3의 코드가 비상업적 용도로 누구나 다운로드 가능해졌습니다.

기존에는 웹 서버를 통해 제한된 예측만 가능했지만, 이번 공개로 학계 연구자들은 AlphaFold3를 자유롭게 활용하여 단백질과 약물 간 상호작용을 직접 예측할 수 있게 되었습니다. 단, AlphaFold3를 사용하기 원하는 개인 또는 기관은 모델 및 그 결과물을 비상업적 목적으로 사용해야 하며, 이에 동의하는 경우에만 다음 링크를 통해 모델 매개변수를 요청해야 합니다:

AlphaFold3은 단백질 구조뿐 아니라 단백질이 다른 분자와 상호작용하는 방식까지 모델링할 수 있다는 점에서 큰 진전을 이루었습니다. 그러나 상용 목적에서는 여전히 제한이 있으며, 딥마인드는 이러한 제한을 두면서도 연구 접근을 허용하려는 균형을 맞추고자 했습니다. 특히 약물 발견에 AlphaFold3을 활용하려는 자회사 Isomorphic Labs가 관련 연구를 이어가고 있습니다.

오픈소스가 갖는 의미와 향후 발전 가능성

AlphaFold3이 오픈 소스로 공개됨에 따라, 과학계는 AI를 활용한 생물학 연구의 혁신적인 발전을 기대하고 있습니다. AlphaFold2의 경우, 공개된 코드 덕분에 과학자들이 AI 도구를 활용해 새로운 단백질을 설계하거나 생명현상에 중요한 단백질을 찾아내는 등의 다양한 응용 연구가 가능했습니다.

딥마인드의 AI 과학 책임자인 푸쉬미트 코흘리는 AlphaFold3이 코드 없이도 재현 가능한 모델임을 증명했으며, 이는 기업과 학계 연구자가 협력하는 분야에서 출판 기준에 대한 논의가 필요함을 시사한다고 밝혔습니다. AlphaFold3의 공개로 인해 새로운 생물학적 발견이 이어질 것이며, 존 점퍼는 이를 통한 다양한 실험적 접근과 예측의 발전을 기대하고 있습니다.

AlphaFold3 이용 약관

AlphaFold 3의 소스 코드 및 매개변수는 Creative Commons Attribution-Non-Commercial ShareAlike 4.0 라이선스(CC-BY-NC-SA 4.0) 하에 제공되며, 특정 용도로 사용하려면 관련 법적 책임과 위험을 사용자 본인이 감수해야 합니다. 이 도구는 이론적 모델링에만 사용 가능하며, 임상적 사용에는 적합하지 않습니다.

AlphaFold 3 모델의 매개변수와 그 결과물은 비상업적 목적으로 사용할 수 있으며, 이용자들이 준수해야 할 제한사항을 포함하고 있습니다. 주요 내용으로는 비상업적으로 용도 제한, 모델 재배포 금지, 출력물 공유 시의 사용 약관 준수 등이 포함되어 있습니다. 자세한 내용은 다음 사용 약관 문서를 참고해주세요:

github.com

google-deepmind/alphafold3/blob/main/WEIGHTS_TERMS_OF_USE.md

# ALPHAFOLD 3 MODEL PARAMETERS TERMS OF USE

Last Modified: 2024-11-09

[AlphaFold 3](https://blog.google/technology/ai/google-deepmind-isomorphic-alphafold-3-ai-model/)
is an AI model developed by [Google DeepMind](https://deepmind.google/) and
[Isomorphic Labs](https://www.isomorphiclabs.com/). It generates 3D structure
predictions of biological molecules, providing model confidence for the
structure predictions. We make the trained model parameters and output generated
using those available free of charge for certain non-commercial uses, in
accordance with these terms of use and the
[AlphaFold 3 Model Parameters Prohibited Use Policy](https://github.com/google-deepmind/alphafold3/blob/main/WEIGHTS_PROHIBITED_USE_POLICY.md).

**Key things to know when using the AlphaFold 3 model parameters and output**

1.  The AlphaFold 3 model parameters and output are **only** available for
    non-commercial use by, or on behalf of, non-commercial organizations
    (*i.e.*, universities, non-profit organizations and research institutes,
    educational, journalism and government bodies). If you are a researcher
    affiliated with a non-commercial organization, provided **you are not a

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그 외, AlphaFold 3는 다양한 서드파티 소프트웨어 및 데이터베이스를 포함하여 동작하며, 데이터베이스 예시로 BFD, UniProt, RNACentral 등이 사용됩니다. 각 데이터베이스는 저작권 또는 사용 제한에 따라 활용될 수 있습니다.

DeepMind의 AlphaFold3 저장소

AlphaFold3 주요 문서 및 정보

설치 문서: installation documentation
입력/출력 설명: input documentation, output documentation
성능 평가: performance documentation
알려진 이슈: known issues documentation

AlphaFold 3 오픈소스 공개 기사

https://www.nature.com/articles/d41586-024-03708-4

이 글은 GPT 모델로 정리한 글을 바탕으로 한 것으로, 원문의 내용 또는 의도와 다르게 정리된 내용이 있을 수 있습니다. 관심있는 내용이시라면 원문도 함께 참고해주세요! 읽으시면서 어색하거나 잘못된 내용을 발견하시면 덧글로 알려주시기를 부탁드립니다.

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