데이터를 gpu에서 cpu로 내릴 때 속도가 느려지는 현상

jetson orin NX를 사용하여 세그멘테이션을 진행하면서 실시간으로 카메라로 부터 받아오는 이미지를 세그멘테이션 작업을 진행하는 작업을 하고있습니다.
해당 작업에서 모델의 출력을 softmax와 argmax를 취한 뒤, cpu로 데이터를 복사하고 numpy로 변환하는 과정에서 속도가 매우 느려집니다.

해당 문제를 해결하기 위해 non_blocking, pin_memory등을 사용하였지만 해결되지 않았습니다. 해당 문제를 어떻게 해결해야 할까요?

먼저 카메라로 부터 이미지를 받아오며 fps를 10으로 조절하여 이미지를 입력으로 사용하며, 사용된 네트워크는 FCN8s를 사용하였고 해당 모델의 출력은 [1, 256, 256, 21]

def pred_to_rgb(self, pred, color_table):
pred = torch.softmax(pred, dim=0)
pred = torch.argmax(pred, dim=0)
pred_ = pred.cpu().numpy()

    pred_rgb = np.zeros_like(pred_, dtype=np.uint8)
    pred_rgb = np.repeat(np.expand_dims(pred_rgb[:, :], axis=-1), 3, -1)
    for i in range(len(CLASSES)):
        pred_rgb[pred_ == i] = np.array(color_table[i])  
           
    return pred_rgb

해당 부분의 pred.cpu().numpy()에서 속도가 매우 느려집니다.

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안녕하세요, 성준 박님.

您가遇到的问题是将数据从GPU传输到CPU的过程中速度很慢,这是许多机器学习和计算密集型应用中常见的瓶颈。这里有一些方法可以帮助您优化这个过程。

1. 使用非阻塞传输(Non-Blocking Transfer)

虽然您已经尝试了 non_blocking 参数,但确保正确使用它是很重要的。非阻塞传输可以让CPU和GPU同时工作,从而减少总处理时间。

pred_ = pred.cpu().numpy()

可以替换为:

import torch

# 使用非阻塞传输
pred_ = pred.cpu(non_blocking=True).numpy()

2. 使用固定内存(Pinned Memory)

固定内存(Pinned Memory)可以显著提高CPU和GPU之间的数据传输速度。您可以使用 torch.cuda.pin_memory() 来实现这一点。

# 在数据加载过程中使用固定内存
data = data.pin_memory()

在您的代码中,您可以在数据加载阶段就将数据转换为固定内存:

# 假设 'data' 是您的输入数据
data = data.pin_memory()

3. 集中大规模传输

小规模且频繁的数据传输会增加传输的开销。尽量将多个小规模传输集中成一个大规模传输。

# 例如,批量处理多个预测结果
batch_preds = []
for pred in preds:
    pred = torch.softmax(pred, dim=0)
    pred = torch.argmax(pred, dim=0)
    batch_preds.append(pred)

# 一次性传输整个批量
batch_preds = torch.stack(batch_preds).cpu(non_blocking=True).numpy()

4. 使用Zero-Copy Memory

如果硬件支持,使用Zero-Copy Memory可以直接访问固定在主机内存中的数据,从而避免不必要的数据复制。

# 使用 cudaHostAllocMapped 来分配零复制内存
import torch

# 假设 'pred' 是您的预测结果
pred = pred.cpu()
pred = pred.contiguous()  # 确保数据是连续的

然后使用 cudaHostAllocMapped 来分配零复制内存,但这需要确保硬件支持并且配置正确[1][3].

5. NVLink(如果可用)

如果您使用的硬件支持NVLink,例如NVIDIA Jetson Orin NX,则可以利用NVLink来提高数据传输速度。NVLink提供了比PCIe更高的带宽,从而减少数据传输相关的瓶颈[1].

6. 并行执行

使用CUDA流(CUDA Streams)来并行执行数据传输和计算。这样可以让GPU在执行计算的同时进行数据传输。

import torch

# 创建一个CUDA流
stream = torch.cuda.Stream()

# 使用非阻塞传输和CUDA流
with torch.cuda.stream(stream):
    pred_ = pred.cpu(non_blocking=True).numpy()

示例代码

以下是一个整合了上述方法的示例代码:

import torch
import numpy as np

def pred_to_rgb(self, pred, color_table):
    # 使用softmax和argmax
    pred = torch.softmax(pred, dim=0)
    pred = torch.argmax(pred, dim=0)

    # 使用非阻塞传输和固定内存
    pred_ = pred.cpu(non_blocking=True).numpy()

    # 转换为RGB格式
    pred_rgb = np.zeros_like(pred_, dtype=np.uint8)
    pred_rgb = np.repeat(np.expand_dims(pred_rgb[:, :], axis=-1), 3, -1)
    for i in range(len(CLASSES)):
        pred_rgb[pred_ == i] = np.array(color_table[i])

    return pred_rgb

# 在数据加载阶段使用固定内存
data = data.pin_memory()

# 批量处理多个预测结果
batch_preds = []
for pred in preds:
    pred = torch.softmax(pred, dim=0)
    pred = torch.argmax(pred, dim=0)
    batch_preds.append(pred)

# 一次性传输整个批量
batch_preds = torch.stack(batch_preds).cpu(non_blocking=True).numpy()

参考资源

  • [CPU에서 GPU로의 데이터 전송을 최적화하는 방법][1]
  • [PyTorch에서 Host와 GPU 메모리 복사 속도 향상 방법][3]

通过这些方法,您可以显著提高从GPU到CPU的数据传输速度,特别是在实时处理和高性能应用中。希望这些建议能帮助您解决当前的问题。 如果还有其他问题或需要进一步的帮助,请随时告诉我。


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안녕하세요! GPU에서 CPU로 데이터를 복사할 때 속도 저하 문제로 어려움을 겪고 계시는 것 같네요. 함께 해결 방법을 찾아보도록 하겠습니다.

먼저 질문 내용을 정리해 보겠습니다. Jetson Orin NX에서 실시간으로 카메라 이미지를 받아 FCN8s 모델로 세그멘테이션을 수행하는 과정에서, 모델 출력에 softmax와 argmax를 적용한 후 CPU로 데이터를 복사하고 NumPy 배열로 변환하는 부분에서 속도 저하가 발생한다는 것이 핵심 문제로 보입니다. non_blocking과 pin_memory 옵션을 사용해 봤지만 해결되지 않았다고 하셨네요.

이 문제를 해결하기 위해 다음과 같은 방법들을 시도해 볼 수 있습니다:

  1. GPU에서 최대한 많은 연산을 수행하고, 최종 결과만 CPU로 복사하세요. 예를 들어, pred_rgb 배열을 GPU 상에서 생성하고 채운 다음, 최종 결과만 CPU로 복사하는 것이 효율적일 수 있습니다.

  2. torch.cuda.synchronize()를 사용하여 GPU 연산이 완료될 때까지 기다린 후 CPU로 복사하세요. 이렇게 하면 GPU와 CPU 간의 비동기 작업으로 인한 지연을 방지할 수 있습니다.

  3. 가능하다면 배치 처리를 활용하세요. 여러 이미지를 한 번에 처리하면 GPU 활용도를 높이고 CPU로의 데이터 전송 횟수를 줄일 수 있습니다.

아래는 위의 제안 사항을 반영한 수정된 코드입니다:

def pred_to_rgb(self, pred, color_table):
    pred = torch.softmax(pred, dim=0)
    pred = torch.argmax(pred, dim=0)
    
    pred_rgb = torch.zeros((pred.size(0), pred.size(1), 3), dtype=torch.uint8, device=pred.device)
    for i in range(len(CLASSES)):
        pred_rgb[pred == i] = torch.tensor(color_table[i], dtype=torch.uint8, device=pred.device)
    
    torch.cuda.synchronize()  # GPU 연산이 완료될 때까지 대기
    pred_rgb = pred_rgb.cpu().numpy()  # 최종 결과만 CPU로 복사
    
    return pred_rgb

이 코드는 GPU 상에서 pred_rgb 배열을 생성하고 채운 후, torch.cuda.synchronize()를 호출하여 GPU 연산이 완료되기를 기다립니다. 그런 다음 최종 결과인 pred_rgb만 CPU로 복사하여 NumPy 배열로 변환합니다.

추가로 참고할 만한 PyTorch 공식 튜토리얼 문서로는 "CUDA semantics" 페이지가 있습니다. 해당 페이지에서는 GPU와 CPU 간 데이터 전송 시 비동기 작업과 동기화에 대해 자세히 설명하고 있습니다.

제 답변이 문제 해결에 도움이 되길 바라며, 추가 질문이 있으시면 언제든 말씀해 주세요. 제 답변에 오류나 부족한 점이 있을 수 있으니 참고해 주시기 바랍니다. 감사합니다!


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안녕하세요! Jetson Orin NX에서 실시간 세그멘테이션 작업을 진행하시면서 GPU에서 CPU로 데이터를 내릴 때 속도가 느려지는 문제를 겪고 계시군요. 특히 pred.cpu().numpy() 부분에서 속도가 느려지는 것을 확인하셨다고 하셨네요. 이 문제는 GPU에서 CPU로 데이터를 전송할 때 발생할 수 있는 일반적인 병목 현상 중 하나입니다.

이 문제를 해결하기 위해 몇 가지 방법을 시도해 볼 수 있습니다:

  1. 비동기 데이터 전송: non_blocking=True를 사용하여 비동기적으로 데이터를 전송하려고 하셨지만, 이 옵션은 pin_memory=True와 함께 사용될 때 효과적입니다. pin_memory=True는 DataLoader에서 데이터를 로드할 때 사용되며, GPU에서 CPU로 데이터를 전송할 때는 직접적인 영향을 미치지 않을 수 있습니다.

  2. 데이터 크기 최적화: 모델의 출력 크기가 [1, 256, 256, 21]이라면, 이 데이터를 CPU로 전송하기 전에 필요한 최소한의 데이터만 전송하도록 최적화할 수 있습니다. 예를 들어, argmax를 수행한 후의 결과는 [1, 256, 256] 크기로 줄어들기 때문에 이 결과만 CPU로 전송하는 것이 좋습니다.

  3. 병렬 처리: 데이터 전송과 후처리를 병렬로 수행할 수 있는 방법을 고려해 보세요. 예를 들어, 데이터 전송이 완료되기 전에 다른 작업을 수행할 수 있도록 비동기적으로 처리할 수 있습니다.

  4. 데이터 전송 최소화: 가능한 경우, GPU에서 직접 후처리를 수행하여 CPU로 전송할 데이터의 양을 줄일 수 있습니다. 예를 들어, argmax와 같은 연산을 GPU에서 수행한 후, 결과를 CPU로 전송하는 것이 좋습니다.

아래는 위의 방법을 적용한 예제 코드입니다:

import torch
import numpy as np

def pred_to_rgb(pred, color_table):
    # GPU에서 softmax와 argmax 수행
    pred = torch.softmax(pred, dim=0)
    pred = torch.argmax(pred, dim=0)
    
    # GPU에서 CPU로 데이터 전송
    pred_ = pred.cpu().numpy()  # non_blocking=True는 여기서 사용 불가
    
    # 후처리
    pred_rgb = np.zeros_like(pred_, dtype=np.uint8)
    pred_rgb = np.repeat(np.expand_dims(pred_rgb[:, :], axis=-1), 3, -1)
    for i in range(len(color_table)):
        pred_rgb[pred_ == i] = np.array(color_table[i])  
           
    return pred_rgb

이와 관련된 더 많은 정보는 PyTorch 공식 튜토리얼에서 확인하실 수 있습니다. PyTorch 튜토리얼 - 데이터 로딩 및 처리에서 pin_memory와 관련된 내용을 참고하실 수 있습니다.

문제가 해결되지 않거나 추가적인 도움이 필요하시면 언제든지 질문해 주세요. 제 답변이 완벽하지 않을 수 있으니, 추가적인 정보를 제공해 주시면 더 나은 도움을 드릴 수 있습니다. 감사합니다!


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