생물학 분야 응용

안녕하세요. 파이토치를 이제 막 입문했습니다. 나무 단면 이미지에서 나이테를 세어주는 걸 목표로 하고 있습니다. 아직 막막하지만 혹시 유사한 분야에 계신 분들이 계시면 함께 토론이라도 할 수 있지 않을까 해서 글을 남김니다.

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안녕하세요, @zulu5 님. 반갑습니다!

생물학 분야는 아니지만, 혹시나 싶어 나무테 세어주는 연구를 찾아보니 아래 링크와 같은 논문이 보이네요.

Abstract

  1. We present an implementable neural network-based automated detection and measurement of tree-ring boundaries from coniferous species.

  2. We trained our Mask R-CNN extensively on over 8,000 manually annotated rings. We assessed the performance of the trained model from our core processing pipeline on real world data.

  3. The CNN performed well, recognizing over 99% of ring boundaries (precision) and a recall value of 95% when tested on real world data. Additionally, we have implemented automatic measurements based on minimum distance between rings. With minimal editing for missed ring detections, these measurements were a 99% match with human measurements of the same samples.

  4. Our CNN is readily deployable through a Docker container and requires only basic command line skills. Application outputs include editable annotations which facilitate the efficient generation of ring-width measurements from tree-ring samples, an important source of environmental data.

찾으시는 주제가 맞는지 모르겠는데, 함께 있는 GitHub 링크도 한 번 참고해보시면 어떨까 싶습니다. :smiley:

새해 복 많이 받으세요~ :red_gift_envelope:

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9bow님 감사합니다! 구해주신 논문이 이해에 큰 도움이 되겠습니다. GitHub도 조만간 시도하겠습니다. 배워야 할 엄청난 정보량에 맘이 설레이네요. 새해 복 많이 받으세요!

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